Una característica particular de Byron Bonilla como futbolista es sacar su mejor versión en partidos internacionales. No importa el momento futbolístico en el que se encuentre el día del partido: si juega un torneo internacional es casi seguro que se crece. Se vio en su momento cuando perteneció a la Selección Nacional y lo repite en el Real Estelí, que le está explotando esa cualidad para seguir dando de qué hablar en la Concacaf donde la Azul y Blanco anhela hacer lo mismo y para tener mayores opciones de lograrlo necesita contar con los mejores de la actualidad.
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Bonilla renunció a la Selección Nacional por motivos personales el 6 de octubre de 2023, pero su nivel de juego ha mejorado desde entonces. Siempre es el mejor del partido o uno de los más destacados del Real Estelí en torneos internacionales. Marcó gol en tres de las cuatro finales del Tren del Norte en 2023, incluyendo al Alajuelense en la final de la Copa Centroamericana, le anotó al América de México en febrero y el pasado martes le metió un doblete al Saprissa, el primero un golazo de tiro libre directo. ¿Por qué no contar con Bonilla en la Selección Nacional para la Liga A de Naciones? Es la pregunta que prensa y aficionados se hacen y el jugador se encargó de responder nuevamente.
Un periodista en la zona mixta del Estadio Independencia le preguntó a Bonilla por la selección y su contestación fue la siguiente: «Ahí está la selección, ojalá les vaya bien», dijo Bonilla y se dio media vuelta para marcharse. De acuerdo a los presentes, la reacción y el gesto de Bonilla ante la consulta confirma que en sus planes no está volver al equipo nacional a corto mediano plazo. Su posición sigue siendo la misma del pasado 6 de febrero, tras su gol al América. . “Amaré por encima de cualquier equipo a la Selección Nacional, pero la verdad no creo volver ahí”, señaló el granadino.
Bonilla explicó en su momento que se marchó por su salud mental. Se dijo muchas cosas al respecto, entre ellas que la culpa la tenía el seleccionador Marco Antonio Figueroa, sin embargo el jugador ha dicho a su círculo cercano que su problema no fue el técnico.